Il mercato di riferimento dell'Accademia è il mercato del lavoro del personale ufficiale della flotta mercantile in primo luogo italiana e europea.
La missione principale dell'Accademia è infatti quella di servire il mercato del lavoro esterno, ossia di ingresso, delle compagnie di navigazione, anche se della missione fa parte l'attività di aggiornamento e di riqualificazione del personale in servizio, che costituisce invece il mercato del lavoro interno alle stesse compagnie.

Su tale mercato del lavoro la domanda in ingresso proviene da tutte le compagnie di navigazione per quanto riguarda gli ufficiali di navigazione e di macchina. Circa la quantità, esistono tuttora stime incerte e diverse, sebbene le cifre del fabbisogno complessivo di ufficiali naviganti da parte della flotta italiana e europea siano dell'ordine delle migliaia per l'oggi e ancora più per il prossimo futuro. Tuttavia le compagnie cercano il personale, anche gli ufficiali, in tutto il mondo per cui non esiste una previsione certa di quanto sia il fabbisogno che esse intendono soddisfare in Italia. Anche perché, se come è vero gli ufficiali italiani sono tra i più apprezzati, la domanda è in buona sostanza condizionata dalla offerta. Negli ultimi anni, la crisi quantitativa e qualitativa dell'offerta di allievi italiani unita al venire meno degli incentivi statali ha ulteriormente aggravato la situazione. Confitarma ha svolto tuttavia nel novembre scorso una prima sommaria indagine sulla domanda di allievi ufficiali di navigazione e di macchina.