Durante l'Accademia gli allievi acquisiscono l'esperienza di 12 mesi di imbarco in qualità di allievo ufficiale usufruendo delle più ampie opportunità di pratica professionale.
La formazione a bordo è fornita dal personale della compagnia di navigazione addetto al tutoring secondo le norme vigenti.
La divisione del percorso formativo su più imbarchi, intervallati dalla formazione a terra, avviene secondo lo schema:
teoria > imbarco > teoria > imbarco > teoria > imbarco > teoria > esame
Nel periodo di imbarco gli allievi sono retribuiti secondo le norme contrattuali e in base all'accordo sottoscritto da Confitarma e dalle Organizzazioni Sindacali di settore, dove sono inoltre elencate le compagnie di navigazione disponibili ad accogliere gli allievi ufficiali iscritti all'Accademia.

Il periodo di formazione a bordo consisterà nel seguire gli allievi per l'intero periodo di imbarco di 12 mesi necessario per conseguire il patentino.
La divisione del periodo su 3 imbarchi, intervallati dalla formazione a terra e da periodi di riposo previsti dai contratti di lavoro, intende favorire il processo di fidelizzazione con una compagnia di navigazione.
Considerata la frequenza dei corsi a terra, i periodi di imbarco e i relativi intervalli di riposo, la durata complessiva del corso coprirà un arco di tempo di circa 24 mesi.

Il periodo di imbarco dell'allievo è disciplinato da un apposito regolamento.

Vademecum per gli imbarchi